{"hash":"2213435163763926731","title":"Nuclear Chromatin Regulation and RNA Surveillance","description":"This cluster centers on nuclear processes, including chromatin regulation (histone modification, DNA methylation, nucleosome remodeling), protein import into the nucleus, and RNA quality control pathways (nuclear mRNA, tRNA, and rRNA surveillance) that drive RNA decay via TRAMP-related mechanisms.","confidence":"Medium","size":7,"edges":21,"triangles":35,"max_degree":6,"top_function":"DNA recombination","members":[{"accession":"KAL1529301.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"KAL1519381.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003"]},{"accession":"KAL1495237.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003"]},{"accession":"KAL1512169.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"KAL1518835.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003"]},{"accession":"KAL1520784.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0001113","GO:0048568","GO:0001111","GO:0009650","GO:0001666","GO:0035315","GO:0033683","GO:0006367","GO:0060543","GO:0009307","GO:0006289","GO:0039530","GO:0000717"]},{"accession":"KAL1522854.1","go_terms":["GO:0000184","GO:0071042","GO:0043629","GO:0034476","GO:0071049","GO:0071051","GO:0000472","GO:0009432","GO:1990120","GO:0048026","GO:0014070","GO:0042273","GO:0016973","GO:0070417","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006265","GO:0006260","GO:1902775","GO:1904570","GO:1903241","GO:0010501","GO:1904574","GO:0006269","GO:0034475","GO:0071031","GO:0048701","GO:0006283","GO:0071035","GO:0031124","GO:0071038","GO:0072715","GO:1990416","GO:0000462","GO:0008306","GO:0000464","GO:0018144","GO:0000466","GO:0000467","GO:1903608","GO:0000378","GO:0006310","GO:1902626","GO:0000393","GO:0000390","GO:0090394","GO:0006268","GO:0000716","GO:0000398","GO:0000463","GO:0045944","GO:0016441","GO:1990417","GO:0000480","GO:0001178","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006605","GO:0070870","GO:0071441","GO:0060303","GO:0006363","GO:0006369","GO:1900050","GO:0019079","GO:0017038","GO:0071894","GO:2000616","GO:0031047","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0000027"]}],"graph":[["KAL1529301.1","KAL1512169.1",0.961],["KAL1529301.1","KAL1518835.1",0.965],["KAL1529301.1","KAL1519381.1",0.976],["KAL1529301.1","KAL1520784.1",0.974],["KAL1529301.1","KAL1522854.1",0.983],["KAL1529301.1","KAL1495237.1",0.977],["KAL1522854.1","KAL1512169.1",0.935],["KAL1522854.1","KAL1518835.1",0.925],["KAL1522854.1","KAL1519381.1",0.919],["KAL1522854.1","KAL1520784.1",0.952],["KAL1522854.1","KAL1495237.1",0.961],["KAL1520784.1","KAL1512169.1",0.933],["KAL1520784.1","KAL1518835.1",0.81],["KAL1520784.1","KAL1519381.1",0.969],["KAL1520784.1","KAL1495237.1",0.976],["KAL1495237.1","KAL1512169.1",0.95],["KAL1495237.1","KAL1518835.1",0.906],["KAL1495237.1","KAL1519381.1",0.98],["KAL1518835.1","KAL1512169.1",0.652],["KAL1518835.1","KAL1519381.1",0.911],["KAL1519381.1","KAL1512169.1",0.949]],"all_go_terms":{"GO:0006311":7,"GO:0071894":7,"GO:0006306":7,"GO:0017038":7,"GO:0009650":3,"GO:0001666":3,"GO:0006367":3,"GO:0071049":7,"GO:0042766":7,"GO:0090394":7,"GO:0071035":7,"GO:0035640":7,"GO:0071038":7,"GO:0000393":7,"GO:0000388":7,"GO:0000716":7,"GO:0010501":7,"GO:0070870":7,"GO:0006605":7,"GO:0014070":7,"GO:0006269":7,"GO:0071031":7,"GO:1990416":7,"GO:0000467":7,"GO:0006310":7,"GO:0042273":7,"GO:0000464":7,"GO:0060303":7,"GO:0045003":7,"GO:0000184":7,"GO:2000616":7,"GO:0071042":7,"GO:0016973":7,"GO:0000717":3,"GO:0031124":7,"GO:0009307":3,"GO:0019079":7,"GO:0001111":3,"GO:1904570":7,"GO:0006283":7,"GO:0000463":7,"GO:0033683":3,"GO:0006363":7,"GO:0031047":7,"GO:0048568":3,"GO:0045944":7,"GO:0042255":7,"GO:0048026":7,"GO:0006369":7,"GO:1903608":7,"GO:0000480":7,"GO:0006289":3,"GO:0000466":7,"GO:0000378":7,"GO:0016441":7,"GO:0060543":3,"GO:0071441":7,"GO:0000398":7,"GO:1990417":7,"GO:0000472":7,"GO:0043629":7,"GO:0034475":7,"GO:0018144":7,"GO:0016584":7,"GO:0048701":7,"GO:1902775":7,"GO:0000462":7,"GO:0009432":7,"GO:0008306":7,"GO:0034476":7,"GO:1904574":7,"GO:0000390":7,"GO:0006301":7,"GO:0035315":3,"GO:0001178":7,"GO:1900050":7,"GO:0006265":7,"GO:0043044":7,"GO:0072715":7,"GO:0070417":7,"GO:1990120":7,"GO:0071051":7,"GO:0006268":7,"GO:1903241":7,"GO:0039530":3,"GO:0006260":7,"GO:0001113":3,"GO:1902626":7,"GO:0000027":1},"recipe_readded":[]}