{"hash":"861038305967589051","title":"Ubiquitin-mediated ERAD and autophagy regulation","description":"The panel is dominated by ubiquitin-related processes: protein autoubiquitination and the ubiquitin-dependent ERAD pathway, plus connections to ER stress-induced apoptotic signaling and autophagosome maturation. While some terms touch on broader trafficking or signaling (nuclear pore localization, TNF pathways), the central theme is regulation of protein quality control and degradation via ubiquitin pathways, encompassing ERAD and autophagy. This supports labeling the cluster as a ubiquitin-driven protein homeostasis module.","confidence":"Medium","size":3,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":null,"members":[{"accession":"XXQ38471.1","go_terms":["GO:0032436","GO:0070911","GO:0034126","GO:0090204","GO:0010286","GO:1901896","GO:0071276","GO:0043392","GO:0060334","GO:0051572","GO:0016925","GO:0043433","GO:0035186","GO:0086004","GO:0030578","GO:1902260","GO:0045944","GO:0045759","GO:0000423","GO:1901097","GO:0033132","GO:1902236","GO:1901340","GO:1903265","GO:0021888","GO:0014070","GO:0010216","GO:0045648","GO:0002109","GO:0006357","GO:0035973","GO:1901799","GO:1902283","GO:0016579","GO:1904378","GO:0030474","GO:0017085","GO:1903071","GO:0006289","GO:0051865","GO:0034140","GO:0030433","GO:1905366","GO:0000028","GO:0010636","GO:0010637","GO:0000753","GO:0071816","GO:0070842","GO:0097237","GO:1900186","GO:1904021","GO:0006517","GO:1904049","GO:0006412"]},{"accession":"XXQ37799.1","go_terms":["GO:0038018","GO:0016558","GO:0030433","GO:0060816","GO:0051865","GO:0042787","GO:0046621","GO:1900095","GO:0070936","GO:0045087","GO:0009896","GO:0046007","GO:1902187","GO:0035372","GO:0000185","GO:0061470","GO:0046597","GO:1901224","GO:0033280","GO:0007026","GO:0042098","GO:0043029","GO:1903886","GO:1903883","GO:0048536","GO:0045623","GO:0048535","GO:0070534","GO:0043123","GO:0050999","GO:1903265","GO:0060546","GO:0006914","GO:0001782","GO:0002635","GO:0048490","GO:0032897","GO:0007014","GO:0051092","GO:0097039","GO:0051607","GO:0061158","GO:0031664","GO:0070979","GO:0031145","GO:0051301","GO:0031030","GO:0032186","GO:1902364","GO:0000921","GO:0031578","GO:0097271","GO:0044810","GO:0090337","GO:0016567","GO:0039536","GO:0002250","GO:0033151","GO:0033209","GO:0009048","GO:0036205","GO:0046328","GO:2000620","GO:0042981","GO:0007250","GO:0070512","GO:0085020","GO:0070535","GO:1903762","GO:1903721","GO:1901253","GO:0090073"]},{"accession":"XXQ35603.1","go_terms":[]}],"graph":[["XXQ37799.1","XXQ35603.1",0.96]],"all_go_terms":{"GO:1902236":1,"GO:0070911":1,"GO:0045759":1,"GO:1900186":1,"GO:1901097":1,"GO:0014070":1,"GO:0090204":1,"GO:0021888":1,"GO:0017085":1,"GO:0010216":1,"GO:0051572":1,"GO:1901340":1,"GO:0010637":1,"GO:0071816":1,"GO:1904049":1,"GO:0045648":1,"GO:1905366":1,"GO:1904021":1,"GO:0006517":1,"GO:0002109":1,"GO:0071276":1,"GO:0000423":1,"GO:0035973":1,"GO:0016579":1,"GO:0035186":1,"GO:0060334":1,"GO:1903265":2,"GO:1902260":1,"GO:1902283":1,"GO:0033132":1,"GO:0051865":2,"GO:0097237":1,"GO:0010636":1,"GO:0006357":1,"GO:0070842":1,"GO:0045944":1,"GO:0010286":1,"GO:0016925":1,"GO:0086004":1,"GO:1903071":1,"GO:0030433":2,"GO:0032436":1,"GO:1904378":1,"GO:0006412":1,"GO:0034126":1,"GO:0006289":1,"GO:0043392":1,"GO:0030578":1,"GO:1901799":1,"GO:0000753":1,"GO:1901896":1,"GO:0034140":1,"GO:0043433":1,"GO:0030474":1,"GO:0000028":1,"GO:0002635":1,"GO:0070979":1,"GO:2000620":1,"GO:0044810":1,"GO:0070512":1,"GO:1903886":1,"GO:0045087":1,"GO:0046621":1,"GO:1902364":1,"GO:0002250":1,"GO:0042787":1,"GO:0050999":1,"GO:0035372":1,"GO:0048490":1,"GO:0031664":1,"GO:0031030":1,"GO:0007026":1,"GO:0097271":1,"GO:0090337":1,"GO:0045623":1,"GO:0042981":1,"GO:0090073":1,"GO:0006914":1,"GO:1900095":1,"GO:0016567":1,"GO:0039536":1,"GO:1903762":1,"GO:0097039":1,"GO:0046007":1,"GO:0033151":1,"GO:0051301":1,"GO:0031145":1,"GO:1902187":1,"GO:0016558":1,"GO:0070534":1,"GO:0051092":1,"GO:0048536":1,"GO:0070535":1,"GO:0000921":1,"GO:0038018":1,"GO:0043029":1,"GO:0061158":1,"GO:0032186":1,"GO:0051607":1,"GO:0001782":1,"GO:0033209":1,"GO:1903721":1,"GO:0046597":1,"GO:0043123":1,"GO:0009048":1,"GO:0031578":1,"GO:0046328":1,"GO:0000185":1,"GO:0061470":1,"GO:1901224":1,"GO:0036205":1,"GO:0048535":1,"GO:0070936":1,"GO:0033280":1,"GO:0007014":1,"GO:0085020":1,"GO:1901253":1,"GO:0007250":1,"GO:0032897":1,"GO:0060546":1,"GO:0042098":1,"GO:1903883":1,"GO:0009896":1,"GO:0060816":1},"recipe_readded":["XXQ39575.1","XXQ36463.1","XXQ32180.1","XXQ31239.1","XXQ31238.1","XXQ35915.1","XXQ34087.1","XXQ36560.1","XXQ34393.1","XXQ35764.1","XXQ39702.1","XXQ39415.1","XXQ35178.1","XXQ30177.1","XXQ37266.1","XXQ35653.1","XXQ29778.1","XXQ37146.1","XXQ36210.1","XXQ33981.1"]}