{"hash":"1238356939610718682","title":"RNA Pol II Transcription Regulation","description":"The top GO terms cluster around DNA-templated transcription and regulation of transcription by RNA polymerase II, including positive regulation under various metabolic conditions and biosynthetic contexts. This points to a group of proteins primarily acting as transcriptional regulators responsive to metabolic cues, rather than a single metabolic pathway.","confidence":"High","size":12,"edges":4,"triangles":0,"max_degree":3,"top_function":"DNA-templated transcription","members":[{"accession":"KAL0489276.1","go_terms":["GO:0009236","GO:0017000","GO:0035690","GO:0006656","GO:0019919","GO:0009102","GO:0030488","GO:0016049","GO:0018012","GO:0006744","GO:0010189","GO:0016126","GO:0043985","GO:0070476","GO:0046690","GO:0002098","GO:0000056","GO:0001300","GO:0090398","GO:0030961","GO:0006370","GO:0009877","GO:0031167","GO:0018364","GO:0036068","GO:0018026","GO:0018027","GO:0036265","GO:1901052","GO:0000183","GO:0018023","GO:0018013","GO:0014075","GO:0002347","GO:0070555","GO:0035902","GO:0006972","GO:0042220","GO:0001887"]},{"accession":"KAL0477916.1","go_terms":["GO:0007029","GO:0019876","GO:0009062","GO:0032543","GO:0070681"]},{"accession":"KAL0489382.1","go_terms":["GO:0048702","GO:0035999","GO:0009113","GO:0009257","GO:0001780"]},{"accession":"KAL0479145.1","go_terms":["GO:1900399","GO:2001196","GO:0061415","GO:0061429","GO:2001158","GO:0035959","GO:0043457","GO:0035948","GO:0045122","GO:0035961","GO:0006351","GO:1904741","GO:2001278","GO:0061414","GO:0035969"]},{"accession":"KAL0483413.1","go_terms":["GO:1900399","GO:2001196","GO:0061415","GO:0061429","GO:2001158","GO:0035959","GO:0043457","GO:0035948","GO:0045122","GO:0035961","GO:0006351","GO:1904741","GO:2001278","GO:0061414","GO:0035969"]},{"accession":"KAL0481929.1","go_terms":["GO:0006355","GO:0006351"]},{"accession":"KAL0486217.1","go_terms":["GO:1900399","GO:2001196","GO:0061415","GO:0061429","GO:2001158","GO:0035959","GO:0043457","GO:0035948","GO:0045122","GO:0035961","GO:0006351","GO:1904741","GO:2001278","GO:0061414","GO:0035969"]},{"accession":"KAL0486259.1","go_terms":["GO:0060040","GO:0045317","GO:0090470","GO:0010371","GO:0010089","GO:0080006","GO:0007383","GO:0048924","GO:0048457","GO:0072498","GO:0010076","GO:0072272","GO:0038092","GO:0010201","GO:0009727","GO:0009722","GO:0006355","GO:0072086","GO:0010192","GO:0042693","GO:0048735","GO:2000652","GO:0060578","GO:0021920","GO:0021516","GO:0008585","GO:0008584","GO:0090092","GO:0030111","GO:0023019","GO:0043524","GO:0090009","GO:0021723","GO:0002380","GO:2000836","GO:0007517","GO:0030910","GO:0030917","GO:0097376","GO:0021569","GO:0060527","GO:0032330","GO:0021854","GO:0031290","GO:0021520","GO:0021521","GO:0022037","GO:0021524","GO:0021526","GO:0021527","GO:0061011","GO:0048880","GO:0035852","GO:0007601","GO:0048839","GO:0061017","GO:0008045","GO:0001755","GO:0030516","GO:0001757","GO:0035565","GO:0003350","GO:0051216","GO:0090427","GO:0014029","GO:0044708","GO:0003168","GO:0021846","GO:0002070","GO:0021978","GO:0035849","GO:0048565","GO:0048713","GO:0021530","GO:0003285","GO:0021623","GO:0021913","GO:0014813","GO:0048486","GO:0048706","GO:0060677","GO:0060065","GO:0048701","GO:0021703","GO:0090103","GO:0035847","GO:0003322","GO:0003327","GO:0006366","GO:0061312","GO:0030878","GO:0007626","GO:0048557","GO:0014807","GO:0060272","GO:0048703","GO:0035623","GO:0048621","GO:0060163","GO:0090190","GO:0072107","GO:0021658","GO:0060928","GO:0098528","GO:0021544","GO:0039020","GO:0021549","GO:0021892","GO:0021893","GO:0042733","GO:0009952","GO:0000122","GO:0060929","GO:1900212","GO:0002076","GO:0043010","GO:0031018","GO:0007519","GO:0031016","GO:0021882","GO:0060041","GO:0010001","GO:0021559","GO:0009798","GO:0021889","GO:0021642","GO:0003309","GO:0001705","GO:0060441","GO:0021798","GO:0072095","GO:0021796","GO:0021570","GO:0061551","GO:1904081","GO:0061296","GO:0007338","GO:0061055","GO:0021568","GO:0001890","GO:0007420","GO:0035880","GO:2000288","GO:0051098","GO:0048935","GO:1902723","GO:0001764","GO:0045617","GO:0021902","GO:0061452","GO:0060435","GO:0021905","GO:0021571","GO:0050905","GO:2001055","GO:0060021","GO:0060971","GO:0072283","GO:0042663","GO:0001889","GO:0021763","GO:0002087","GO:0021983","GO:0072075","GO:0035284","GO:0007275","GO:0048048","GO:0021985","GO:0007479","GO:1901738","GO:0021986","GO:0007384","GO:0021937","GO:0045686","GO:1902871","GO:1902870","GO:0048536","GO:0061197","GO:0060133","GO:0021979","GO:0060876","GO:0021912","GO:0021759","GO:0021918","GO:0060037","GO:0021754","GO:0035115","GO:0035116","GO:0021615","GO:0060126","GO:0007506","GO:0007507","GO:0042472","GO:0042475","GO:0042474","GO:0007501","GO:0071542","GO:0003148","GO:0048850","GO:0048853","GO:0048852","GO:0030900","GO:0030901","GO:0001759","GO:0072181","GO:0046513","GO:0060580"]},{"accession":"KAL0489879.1","go_terms":["GO:0060040","GO:0045317","GO:0090470","GO:0010371","GO:0010089","GO:0080006","GO:0007383","GO:0048924","GO:0048457","GO:0072498","GO:0010076","GO:0072272","GO:0038092","GO:0010201","GO:0009727","GO:0009722","GO:0006355","GO:0072086","GO:0010192","GO:0042693","GO:0048735","GO:2000652","GO:0060578","GO:0021920","GO:0021516","GO:0008585","GO:0008584","GO:0090092","GO:0030111","GO:0023019","GO:0043524","GO:0090009","GO:0021723","GO:0002380","GO:2000836","GO:0007517","GO:0030910","GO:0030917","GO:0097376","GO:0021569","GO:0060527","GO:0032330","GO:0021854","GO:0031290","GO:0021520","GO:0021521","GO:0022037","GO:0021524","GO:0021526","GO:0021527","GO:0061011","GO:0048880","GO:0035852","GO:0007601","GO:0048839","GO:0061017","GO:0008045","GO:0001755","GO:0030516","GO:0001757","GO:0035565","GO:0003350","GO:0051216","GO:0090427","GO:0014029","GO:0044708","GO:0003168","GO:0021846","GO:0002070","GO:0021978","GO:0035849","GO:0048565","GO:0048713","GO:0021530","GO:0003285","GO:0021623","GO:0021913","GO:0014813","GO:0048486","GO:0048706","GO:0060677","GO:0060065","GO:0048701","GO:0021703","GO:0090103","GO:0035847","GO:0003322","GO:0003327","GO:0006366","GO:0061312","GO:0030878","GO:0007626","GO:0048557","GO:0014807","GO:0060272","GO:0048703","GO:0035623","GO:0048621","GO:0060163","GO:0090190","GO:0072107","GO:0021658","GO:0060928","GO:0098528","GO:0021544","GO:0039020","GO:0021549","GO:0021892","GO:0021893","GO:0042733","GO:0009952","GO:0000122","GO:0060929","GO:1900212","GO:0002076","GO:0043010","GO:0031018","GO:0007519","GO:0031016","GO:0021882","GO:0060041","GO:0010001","GO:0021559","GO:0009798","GO:0021889","GO:0021642","GO:0003309","GO:0001705","GO:0060441","GO:0021798","GO:0072095","GO:0021796","GO:0021570","GO:0061551","GO:1904081","GO:0061296","GO:0007338","GO:0061055","GO:0021568","GO:0001890","GO:0007420","GO:0035880","GO:2000288","GO:0051098","GO:0048935","GO:1902723","GO:0001764","GO:0045617","GO:0021902","GO:0061452","GO:0060435","GO:0021905","GO:0021571","GO:0050905","GO:2001055","GO:0060021","GO:0060971","GO:0072283","GO:0042663","GO:0001889","GO:0021763","GO:0002087","GO:0021983","GO:0072075","GO:0035284","GO:0007275","GO:0048048","GO:0021985","GO:0007479","GO:1901738","GO:0021986","GO:0007384","GO:0021937","GO:0045686","GO:1902871","GO:1902870","GO:0048536","GO:0061197","GO:0060133","GO:0021979","GO:0060876","GO:0021912","GO:0021759","GO:0021918","GO:0060037","GO:0021754","GO:0035115","GO:0035116","GO:0021615","GO:0060126","GO:0007506","GO:0007507","GO:0042472","GO:0042475","GO:0042474","GO:0007501","GO:0071542","GO:0003148","GO:0048850","GO:0048853","GO:0048852","GO:0030900","GO:0030901","GO:0001759","GO:0072181","GO:0046513","GO:0060580"]},{"accession":"KAL0490861.1","go_terms":["GO:0060040","GO:0045317","GO:0090470","GO:0010371","GO:0010089","GO:0080006","GO:0007383","GO:0048924","GO:0048457","GO:0072498","GO:0010076","GO:0072272","GO:0038092","GO:0010201","GO:0009727","GO:0009722","GO:0006355","GO:0072086","GO:0010192","GO:0042693","GO:0048735","GO:2000652"]},{"accession":"KAL0489857.1","go_terms":["GO:0099641","GO:0071480","GO:0032387","GO:0050821","GO:0032355","GO:0009644","GO:0030308","GO:0032463","GO:2000378","GO:0070309","GO:0006936","GO:0070141","GO:0031109","GO:0009408","GO:0007568","GO:0042542","GO:1900034","GO:0051403","GO:1905907"]},{"accession":"KAL0482121.1","go_terms":[]}],"graph":[["KAL0489879.1","KAL0483413.1",0.82],["KAL0481929.1","KAL0479145.1",0.59],["KAL0479145.1","KAL0482121.1",0.809],["KAL0479145.1","KAL0483413.1",0.685]],"all_go_terms":{"GO:0009877":1,"GO:0018013":1,"GO:0035902":1,"GO:0009236":1,"GO:0018027":1,"GO:0014075":1,"GO:0006744":1,"GO:0016049":1,"GO:0009102":1,"GO:0006656":1,"GO:0018012":1,"GO:0030488":1,"GO:0010189":1,"GO:0002098":1,"GO:0018026":1,"GO:0001300":1,"GO:0016126":1,"GO:0030961":1,"GO:0000183":1,"GO:0018023":1,"GO:0006972":1,"GO:0018364":1,"GO:0036068":1,"GO:0031167":1,"GO:0035690":1,"GO:0000056":1,"GO:0070555":1,"GO:0043985":1,"GO:0042220":1,"GO:0046690":1,"GO:0070476":1,"GO:0006370":1,"GO:1901052":1,"GO:0001887":1,"GO:0017000":1,"GO:0090398":1,"GO:0019919":1,"GO:0036265":1,"GO:0002347":1,"GO:0032543":1,"GO:0019876":1,"GO:0007029":1,"GO:0070681":1,"GO:0009062":1,"GO:0035999":1,"GO:0001780":1,"GO:0048702":1,"GO:0009257":1,"GO:0009113":1,"GO:0035959":3,"GO:1904741":3,"GO:1900399":3,"GO:0035948":3,"GO:0035961":3,"GO:0006351":4,"GO:0061414":3,"GO:0045122":3,"GO:2001196":3,"GO:0043457":3,"GO:0035969":3,"GO:2001278":3,"GO:0061415":3,"GO:2001158":3,"GO:0061429":3,"GO:0006355":4,"GO:0048701":2,"GO:0045686":2,"GO:0060527":2,"GO:0048536":2,"GO:0009722":3,"GO:0021549":2,"GO:0006366":2,"GO:0021516":2,"GO:0042474":2,"GO:0090427":2,"GO:0048880":2,"GO:0008584":2,"GO:0035847":2,"GO:0048853":2,"GO:0031016":2,"GO:0021985":2,"GO:0048850":2,"GO:0021893":2,"GO:0030917":2,"GO:0007507":2,"GO:0072107":2,"GO:0021979":2,"GO:0090092":2,"GO:0050905":2,"GO:0030910":2,"GO:0021854":2,"GO:0072272":3,"GO:0035880":2,"GO:0030516":2,"GO:0008585":2,"GO:0021524":2,"GO:2001055":2,"GO:0090103":2,"GO:0021986":2,"GO:0048486":2,"GO:0021723":2,"GO:0072075":2,"GO:0090470":3,"GO:0021570":2,"GO:0048565":2,"GO:0061296":2,"GO:0039020":2,"GO:0061551":2,"GO:2000652":3,"GO:0030878":2,"GO:0030111":2,"GO:0072095":2,"GO:0035849":2,"GO:0001889":2,"GO:0007519":2,"GO:0001890":2,"GO:0035623":2,"GO:0060272":2,"GO:0035852":2,"GO:0007506":2,"GO:0021530":2,"GO:0030901":2,"GO:0003309":2,"GO:0042663":2,"GO:0007479":2,"GO:0060126":2,"GO:0021759":2,"GO:0031290":2,"GO:0060441":2,"GO:0021796":2,"GO:0060065":2,"GO:0001705":2,"GO:0051098":2,"GO:0090009":2,"GO:0021623":2,"GO:0007275":2,"GO:0010192":3,"GO:0021568":2,"GO:0035115":2,"GO:0021754":2,"GO:0060929":2,"GO:0061055":2,"GO:0042693":3,"GO:0010076":3,"GO:0032330":2,"GO:0060971":2,"GO:0048621":2,"GO:0046513":2,"GO:2000836":2,"GO:0021920":2,"GO:0097376":2,"GO:0035116":2,"GO:0060435":2,"GO:0045317":3,"GO:0007420":2,"GO:0072181":2,"GO:0002380":2,"GO:0021798":2,"GO:0009727":3,"GO:0048557":2,"GO:0060163":2,"GO:0031018":2,"GO:0000122":2,"GO:0042733":2,"GO:0043010":2,"GO:1901738":2,"GO:0061197":2,"GO:0003350":2,"GO:0014807":2,"GO:0072086":3,"GO:0009952":2,"GO:0003322":2,"GO:0060037":2,"GO:0021913":2,"GO:0007338":2,"GO:0090190":2,"GO:0021703":2,"GO:0007601":2,"GO:0060578":2,"GO:0001755":2,"GO:0048839":2,"GO:0002076":2,"GO:0061452":2,"GO:0021983":2,"GO:0001759":2,"GO:0048048":2,"GO:0043524":2,"GO:0042475":2,"GO:0080006":3,"GO:0021889":2,"GO:0048735":3,"GO:0060928":2,"GO:0010089":3,"GO:0001757":2,"GO:0061312":2,"GO:0048713":2,"GO:0021615":2,"GO:0003168":2,"GO:0021658":2,"GO:0021544":2,"GO:0021521":2,"GO:0021918":2,"GO:0007501":2,"GO:0021571":2,"GO:1902870":2,"GO:0045617":2,"GO:0014029":2,"GO:0048706":2,"GO:0071542":2,"GO:0003327":2,"GO:0021520":2,"GO:0002070":2,"GO:0061011":2,"GO:0060876":2,"GO:0030900":2,"GO:0098528":2,"GO:1902871":2,"GO:0060580":2,"GO:0009798":2,"GO:0060041":2,"GO:0014813":2,"GO:0010201":3,"GO:2000288":2,"GO:0038092":3,"GO:0072283":2,"GO:0010001":2,"GO:0021763":2,"GO:0021937":2,"GO:0007626":2,"GO:0021902":2,"GO:0007383":3,"GO:1904081":2,"GO:0060133":2,"GO:0048703":2,"GO:1902723":2,"GO:0021892":2,"GO:0008045":2,"GO:0061017":2,"GO:0007517":2,"GO:0035565":2,"GO:0010371":3,"GO:0021912":2,"GO:0021527":2,"GO:0072498":3,"GO:0021642":2,"GO:0003148":2,"GO:0048935":2,"GO:0060040":3,"GO:0021569":2,"GO:1900212":2,"GO:0021846":2,"GO:0003285":2,"GO:0022037":2,"GO:0044708":2,"GO:0023019":2,"GO:0021978":2,"GO:0007384":2,"GO:0042472":2,"GO:0048457":3,"GO:0051216":2,"GO:0060021":2,"GO:0021559":2,"GO:0048924":3,"GO:0002087":2,"GO:0021526":2,"GO:0060677":2,"GO:0021905":2,"GO:0035284":2,"GO:0048852":2,"GO:0021882":2,"GO:0001764":2,"GO:0071480":1,"GO:0051403":1,"GO:0007568":1,"GO:0032463":1,"GO:0042542":1,"GO:0030308":1,"GO:0006936":1,"GO:1900034":1,"GO:0009408":1,"GO:0050821":1,"GO:0032387":1,"GO:1905907":1,"GO:0070309":1,"GO:2000378":1,"GO:0099641":1,"GO:0009644":1,"GO:0032355":1,"GO:0070141":1,"GO:0031109":1},"recipe_readded":["KAL0488168.1","KAL0489434.1","KAL0476314.1","KAL0491180.1","KAL0483821.1","KAL0487978.1","KAL0476833.1","KAL0479206.1","KAL0483132.1","KAL0489714.1","KAL0480696.1","KAL0485296.1","KAL0488982.1","KAL0491229.1","KAL0488858.1","KAL0489340.1","KAL0488494.1","KAL0477802.1","KAL0483878.1","KAL0491490.1"]}