{"hash":"1766242241526970183","title":"DNA replication and repair with transcription regulation","description":"Top GO terms center on DNA replication and repair (leading strand elongation, replication, NER, translesion synthesis, checkpoint signaling). Transcription-related terms (RNA Pol II elongation, preinitiation complex assembly) hint at coordination with transcription during DNA metabolism. A few items (somatic hypermutation, viral genome replication) are context-specific but still related to DNA modification/replication processes. Overall, the cluster is best described as DNA replication and repair with transcription coordination.","confidence":"Medium","size":26,"edges":1,"triangles":0,"max_degree":1,"top_function":"DNA replication","members":[{"accession":"KAI9173135.1","go_terms":[]},{"accession":"KAI9183285.1","go_terms":["GO:0071494","GO:0006297","GO:0042276","GO:0070987","GO:0006261"]},{"accession":"KAI9175493.1","go_terms":[]},{"accession":"KAI9190018.1","go_terms":["GO:0006295","GO:0006296","GO:1905768","GO:1905765","GO:0061819","GO:0009650","GO:0031573","GO:0072429","GO:0031297","GO:0033314","GO:1904357","GO:0000727","GO:0051097","GO:1901255","GO:0000712","GO:0010520","GO:0000736","GO:0000737","GO:0006277","GO:0007095","GO:0006297","GO:0006290","GO:0006284","GO:0055093","GO:0007435","GO:0010332","GO:0071707","GO:0048536","GO:0048535","GO:0016579","GO:0006286","GO:0006287","GO:1990506","GO:0061674","GO:0006288","GO:0045471","GO:0051402","GO:0006954","GO:0008630","GO:0007568","GO:0048872","GO:0071897","GO:0016446"]},{"accession":"KAI9159254.1","go_terms":["GO:0071042","GO:0001178","GO:1990120","GO:0071049","GO:0042766","GO:0006306","GO:0006301","GO:0043044","GO:0006260","GO:1902775","GO:0006268","GO:0006269","GO:0034475","GO:0034476","GO:0071051","GO:0006283","GO:0072715","GO:0006605","GO:0000462","GO:0000463","GO:0000464","GO:0000466","GO:0000467","GO:0070870","GO:0000393","GO:0000390","GO:0000716","GO:0000398","GO:0071441","GO:0016441","GO:0060303","GO:0018144","GO:1902626","GO:0016973","GO:0042255","GO:0000388","GO:0035640","GO:0006363","GO:0006369","GO:0048701","GO:0008306","GO:1900050","GO:0048026","GO:0042273","GO:1903241","GO:0019079","GO:0017038","GO:0045944","GO:0071894","GO:2000616","GO:0009432","GO:0070417","GO:1904570","GO:0010501","GO:1904574","GO:0071031","GO:0071035","GO:0071038","GO:0031047","GO:0043629","GO:0000378","GO:0016584","GO:0006311","GO:0045003","GO:0090394","GO:1990416","GO:0061412","GO:1901582","GO:1901581","GO:0046020","GO:0021553","GO:0070869","GO:0035128","GO:0003226","GO:1902661","GO:0000209","GO:0000722","GO:0043486","GO:0006346","GO:0051225","GO:0044109","GO:0010994","GO:0031496","GO:0032079","GO:0001208","GO:0007131","GO:1904908","GO:0045898","GO:0031508","GO:0036292","GO:0030491","GO:0010571","GO:1900189","GO:0007098","GO:0042790"]},{"accession":"KAI9189095.1","go_terms":["GO:0032922","GO:2000323","GO:0071000","GO:2000850","GO:0019915","GO:0009650","GO:0045475","GO:1902448","GO:0009638","GO:0042332","GO:0050980","GO:0009584","GO:0050958","GO:0048574","GO:0009588","GO:0033762","GO:1902347","GO:0006975","GO:0000719","GO:0042754","GO:0018298","GO:0009785","GO:0009646","GO:0010117","GO:0010343","GO:1901371","GO:1901332","GO:0010617","GO:0010075","GO:1901672","GO:0010244","GO:0045187","GO:2000001","GO:0043153","GO:0010118"]},{"accession":"KAI9190051.1","go_terms":["GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0006260","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0051301","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617"]},{"accession":"KAI9164320.1","go_terms":["GO:0006295","GO:0006286","GO:0045876","GO:0006284","GO:0035753","GO:0045190","GO:0090267","GO:0007613","GO:0006289","GO:0031292","GO:0002455","GO:0001302","GO:0000734","GO:0006260","GO:0016446","GO:1903469","GO:0071140"]},{"accession":"KAI9155949.1","go_terms":["GO:0010142","GO:0061623","GO:0019288","GO:0019287","GO:0000435","GO:0046396","GO:0042352","GO:0046835","GO:0006695","GO:0009088","GO:0019402","GO:0009086","GO:0009092"]},{"accession":"KAI9184608.1","go_terms":[]},{"accession":"KAI9183683.1","go_terms":["GO:0006431","GO:0006430","GO:0006432","GO:0051351","GO:0048514","GO:0008033","GO:0006412"]},{"accession":"KAI9188269.1","go_terms":["GO:0061738","GO:0031117","GO:0051260","GO:0030420","GO:2001171","GO:0034214","GO:1903862","GO:0032968","GO:0070842","GO:0001824","GO:0006260","GO:0034551","GO:0070682","GO:0033314","GO:0032979","GO:0051013","GO:0046034","GO:1901800","GO:1990171","GO:0016485","GO:0045899","GO:0030968","GO:0006272","GO:0070987","GO:0043335","GO:0070676","GO:0070370","GO:1903007","GO:0090261","GO:0070914","GO:0061641","GO:0061166","GO:1903715","GO:0051301","GO:0006888","GO:0045053","GO:0001319","GO:0035494","GO:0019079","GO:0070414","GO:0097352","GO:0071218","GO:0016562","GO:2000158","GO:0070389","GO:0018279","GO:0006406","GO:0051131","GO:0048219","GO:0030433","GO:1903724","GO:0034599","GO:0090296","GO:0072389","GO:0045041","GO:0016558","GO:0000733","GO:0070407","GO:0070651","GO:0071712","GO:0035617"]},{"accession":"KAI9149817.1","go_terms":["GO:0019563","GO:0046168","GO:0006127","GO:0030851","GO:0042135","GO:0034720","GO:0051412","GO:0046653","GO:0035563","GO:0010044","GO:0001701","GO:0043046","GO:0007369","GO:0009106","GO:0098869","GO:0010725","GO:0060992","GO:2000179","GO:1990138","GO:0046886","GO:0045454","GO:0014063","GO:0045793","GO:0007568","GO:0071320","GO:0045654","GO:0009061","GO:0006121","GO:0006120","GO:0042391","GO:0051068","GO:0042493","GO:0009435","GO:0006099","GO:0021983","GO:0032496","GO:0048240","GO:0021987","GO:0042420","GO:0000380","GO:0045648","GO:0006096","GO:0016575","GO:2000648","GO:0009228","GO:0045471","GO:0046098","GO:0051572","GO:0051573","GO:0002098","GO:0010269","GO:0042551","GO:0006103","GO:0045964","GO:0036088","GO:0008283","GO:0042416","GO:0010976","GO:0009409","GO:0055114","GO:0006579","GO:0033514","GO:0042742","GO:0019835","GO:0006562","GO:0009635","GO:1902114","GO:0009229","GO:0006915","GO:0002097","GO:0055130"]},{"accession":"KAI9188002.1","go_terms":["GO:0006824","GO:0030253","GO:0030153","GO:0017004","GO:0031460","GO:0010949","GO:0046677","GO:0009432","GO:0099040","GO:0046618","GO:0042883","GO:0015734","GO:0008643","GO:0042760","GO:0015910","GO:1900753","GO:0015777","GO:0006855","GO:0019885","GO:0099133","GO:0090374","GO:0046689","GO:0060702","GO:0006289","GO:0015821","GO:0045332","GO:0015803","GO:0000770","GO:0015888","GO:0035461","GO:0043213","GO:0045796","GO:0003333","GO:0043215","GO:0001407","GO:0042953","GO:0072089","GO:0015689","GO:0015886"]},{"accession":"KAI9179663.1","go_terms":["GO:0010142","GO:0061623","GO:0019288","GO:0019287","GO:0000435","GO:0046396","GO:0042352","GO:0046835","GO:0006695","GO:0009088","GO:0019402","GO:0009086","GO:0009092"]},{"accession":"KAI9175784.1","go_terms":["GO:0006596","GO:0009435","GO:0006107","GO:0046686","GO:0042158"]},{"accession":"KAI9148573.1","go_terms":[]},{"accession":"KAI9188643.1","go_terms":["GO:0006310","GO:0071932","GO:0000002","GO:0097046","GO:0032508","GO:0032211","GO:0044806","GO:1902983","GO:0051974","GO:0043504","GO:1903469","GO:0000723"]},{"accession":"KAI9178746.1","go_terms":["GO:0006297","GO:0090305","GO:0042276","GO:0016539","GO:1903460","GO:1902975","GO:0006287","GO:1902981","GO:0045004","GO:0006279","GO:0006278","GO:0000734","GO:1904161","GO:0039693","GO:0043137","GO:1903459","GO:0035822","GO:0070987","GO:0055089","GO:0006260","GO:0006272"]},{"accession":"KAI9179229.1","go_terms":["GO:0016311"]},{"accession":"KAI9189175.1","go_terms":["GO:0032225","GO:0050884","GO:0017001","GO:0046929","GO:0019243","GO:0030420","GO:0090503","GO:0031126","GO:0034247","GO:0046677","GO:0006364","GO:0098789","GO:0034414"]},{"accession":"KAI9189406.1","go_terms":["GO:0031573","GO:0007534","GO:0048304","GO:0045190","GO:0007050","GO:0061500","GO:0051096","GO:0008340","GO:0043570","GO:0042771","GO:0006311","GO:0001701","GO:0006302","GO:0007281","GO:0000735","GO:0036297","GO:0006119","GO:0043111","GO:0048298","GO:0010777","GO:0016446","GO:0045910"]},{"accession":"KAI9189569.1","go_terms":["GO:0002100","GO:0019858","GO:0006217","GO:0009231","GO:0046109","GO:0046677","GO:0009972","GO:0044206","GO:0006147"]},{"accession":"KAI9190104.1","go_terms":["GO:0031538","GO:0008103","GO:0030335","GO:0035011","GO:2000024"]},{"accession":"KAI9183397.1","go_terms":["GO:0006048","GO:0052704","GO:0006541","GO:0009113","GO:0006189","GO:0009116","GO:0070981","GO:0033050","GO:0005975","GO:0097175","GO:0019647","GO:0097173","GO:0009254","GO:0006351","GO:0034219","GO:0052699","GO:0006751"]},{"accession":"KAI9183029.1","go_terms":["GO:0001193","GO:0031564","GO:0051123","GO:0031440","GO:0060303","GO:0070827","GO:2001253","GO:0006362","GO:0010793","GO:0090239","GO:0006368","GO:0042797","GO:0032968","GO:0045899","GO:0006283","GO:0001172","GO:0042254","GO:0006363","GO:0006367","GO:0006366","GO:0006386","GO:0006379","GO:0042790","GO:0097190"]}],"graph":[["KAI9188643.1","KAI9148573.1",0.961]],"all_go_terms":{"GO:0042276":2,"GO:0070987":4,"GO:0071494":1,"GO:0006261":1,"GO:0006297":3,"GO:0006954":1,"GO:0006286":2,"GO:0048535":1,"GO:0006287":2,"GO:0006277":1,"GO:0010332":1,"GO:1901255":1,"GO:0061819":1,"GO:0006296":1,"GO:0071897":1,"GO:0000736":1,"GO:0010520":1,"GO:0007568":2,"GO:0008630":1,"GO:0071707":1,"GO:0033314":3,"GO:0006284":2,"GO:0000737":1,"GO:0051402":1,"GO:0061674":1,"GO:0031573":2,"GO:0051097":1,"GO:0031297":1,"GO:0055093":1,"GO:1904357":1,"GO:0007435":1,"GO:0048536":1,"GO:0016579":1,"GO:0048872":1,"GO:0007095":1,"GO:1905765":1,"GO:0009650":2,"GO:0006288":1,"GO:0045471":2,"GO:0000712":1,"GO:1905768":1,"GO:0006295":2,"GO:0006290":1,"GO:0000727":1,"GO:0016446":3,"GO:0072429":1,"GO:1990506":1,"GO:0045898":1,"GO:0042766":1,"GO:0000463":1,"GO:0045944":1,"GO:0000716":1,"GO:2000616":1,"GO:0043486":1,"GO:0007098":1,"GO:0006346":1,"GO:0001178":1,"GO:1901582":1,"GO:0008306":1,"GO:0016584":1,"GO:0003226":1,"GO:0071031":1,"GO:0006605":1,"GO:0070869":1,"GO:0031508":1,"GO:0016973":1,"GO:0060303":2,"GO:1900189":1,"GO:0043629":1,"GO:0006301":1,"GO:1990120":1,"GO:0045003":1,"GO:0071035":1,"GO:0000378":1,"GO:0010571":1,"GO:0006260":5,"GO:1901581":1,"GO:0071038":1,"GO:0000393":1,"GO:0010994":1,"GO:0044109":1,"GO:0006369":1,"GO:0006269":1,"GO:0017038":1,"GO:0009432":2,"GO:0006283":2,"GO:0000462":1,"GO:0031047":1,"GO:0006268":1,"GO:1904570":1,"GO:0019079":3,"GO:0046020":1,"GO:0071049":1,"GO:1903241":1,"GO:1990416":1,"GO:0000722":1,"GO:0070417":1,"GO:0000209":1,"GO:0071441":1,"GO:0042790":2,"GO:0090394":1,"GO:0071894":1,"GO:0000398":1,"GO:0071042":1,"GO:0034475":1,"GO:0031496":1,"GO:0032079":1,"GO:1904908":1,"GO:0036292":1,"GO:0042273":1,"GO:1902775":1,"GO:0048026":1,"GO:0007131":1,"GO:0071051":1,"GO:0000390":1,"GO:0016441":1,"GO:0043044":1,"GO:1902661":1,"GO:0006311":2,"GO:0000388":1,"GO:0006306":1,"GO:0048701":1,"GO:0018144":1,"GO:1900050":1,"GO:0030491":1,"GO:0034476":1,"GO:0021553":1,"GO:0051225":1,"GO:0000466":1,"GO:0035128":1,"GO:0000464":1,"GO:0006363":2,"GO:0072715":1,"GO:0061412":1,"GO:1902626":1,"GO:0001208":1,"GO:0070870":1,"GO:0010501":1,"GO:0035640":1,"GO:0042255":1,"GO:0000467":1,"GO:1904574":1,"GO:0043153":1,"GO:0000719":1,"GO:0050958":1,"GO:1902347":1,"GO:0048574":1,"GO:1901332":1,"GO:0006975":1,"GO:0045475":1,"GO:2000001":1,"GO:1901672":1,"GO:0019915":1,"GO:0010118":1,"GO:2000850":1,"GO:0010075":1,"GO:0009588":1,"GO:0010117":1,"GO:0010343":1,"GO:0045187":1,"GO:0009646":1,"GO:0018298":1,"GO:0071000":1,"GO:0009785":1,"GO:0050980":1,"GO:1902448":1,"GO:1901371":1,"GO:0042332":1,"GO:0009584":1,"GO:0033762":1,"GO:0010244":1,"GO:0010617":1,"GO:2000323":1,"GO:0009638":1,"GO:0032922":1,"GO:0042754":1,"GO:0070682":2,"GO:1990171":2,"GO:1903715":2,"GO:0061166":2,"GO:0035617":2,"GO:0034551":2,"GO:0090296":2,"GO:1903007":2,"GO:0097352":2,"GO:0030968":2,"GO:0070842":2,"GO:0070914":2,"GO:0006406":2,"GO:0034599":2,"GO:0045041":2,"GO:1901800":2,"GO:0051131":2,"GO:0016558":2,"GO:2001171":2,"GO:0001319":2,"GO:0070414":2,"GO:0018279":2,"GO:0035494":2,"GO:0071712":2,"GO:0070407":2,"GO:0070389":2,"GO:0030420":3,"GO:0070651":2,"GO:0006888":2,"GO:0061738":2,"GO:0030433":2,"GO:0071218":2,"GO:0070676":2,"GO:0048219":2,"GO:1903724":2,"GO:0051301":2,"GO:0045053":2,"GO:0051013":2,"GO:0001824":2,"GO:0032979":2,"GO:0072389":2,"GO:0061641":2,"GO:1903862":2,"GO:2000158":2,"GO:0051260":2,"GO:0000733":2,"GO:0043335":2,"GO:0032968":3,"GO:0070370":2,"GO:0016562":2,"GO:0016485":2,"GO:0031117":2,"GO:0034214":2,"GO:0090261":2,"GO:0046034":2,"GO:0006272":3,"GO:0045899":3,"GO:0045876":1,"GO:0000734":2,"GO:0007613":1,"GO:0090267":1,"GO:0031292":1,"GO:0035753":1,"GO:0002455":1,"GO:0071140":1,"GO:0006289":2,"GO:0045190":2,"GO:1903469":2,"GO:0001302":1,"GO:0046835":2,"GO:0042352":2,"GO:0010142":2,"GO:0000435":2,"GO:0046396":2,"GO:0019288":2,"GO:0019287":2,"GO:0006695":2,"GO:0019402":2,"GO:0009092":2,"GO:0061623":2,"GO:0009088":2,"GO:0009086":2,"GO:0006431":1,"GO:0051351":1,"GO:0048514":1,"GO:0008033":1,"GO:0006432":1,"GO:0006412":1,"GO:0006430":1,"GO:0060992":1,"GO:0046886":1,"GO:0010976":1,"GO:0021987":1,"GO:0006103":1,"GO:0009635":1,"GO:0009106":1,"GO:0042416":1,"GO:0055130":1,"GO:0006579":1,"GO:0051068":1,"GO:0009061":1,"GO:0006096":1,"GO:0021983":1,"GO:1902114":1,"GO:0043046":1,"GO:0006562":1,"GO:2000648":1,"GO:0002098":1,"GO:0010269":1,"GO:0042391":1,"GO:0042493":1,"GO:0045648":1,"GO:0010044":1,"GO:0045454":1,"GO:0042135":1,"GO:1990138":1,"GO:0006915":1,"GO:0032496":1,"GO:0002097":1,"GO:0014063":1,"GO:0006127":1,"GO:0098869":1,"GO:0045793":1,"GO:0006121":1,"GO:0006120":1,"GO:0009435":2,"GO:0006099":1,"GO:0008283":1,"GO:2000179":1,"GO:0046098":1,"GO:0046653":1,"GO:0055114":1,"GO:0051573":1,"GO:0009229":1,"GO:0034720":1,"GO:0042420":1,"GO:0019835":1,"GO:0000380":1,"GO:0071320":1,"GO:0036088":1,"GO:0033514":1,"GO:0048240":1,"GO:0046168":1,"GO:0042742":1,"GO:0007369":1,"GO:0051412":1,"GO:0051572":1,"GO:0009228":1,"GO:0001701":2,"GO:0016575":1,"GO:0010725":1,"GO:0045964":1,"GO:0009409":1,"GO:0035563":1,"GO:0045654":1,"GO:0030851":1,"GO:0019563":1,"GO:0042551":1,"GO:0006824":1,"GO:0015803":1,"GO:1900753":1,"GO:0046689":1,"GO:0015734":1,"GO:0017004":1,"GO:0006855":1,"GO:0015777":1,"GO:0015910":1,"GO:0000770":1,"GO:0072089":1,"GO:0046618":1,"GO:0030153":1,"GO:0045332":1,"GO:0019885":1,"GO:0060702":1,"GO:0090374":1,"GO:0015821":1,"GO:0042953":1,"GO:0015886":1,"GO:0015689":1,"GO:0003333":1,"GO:0045796":1,"GO:0043215":1,"GO:0015888":1,"GO:0043213":1,"GO:0031460":1,"GO:0008643":1,"GO:0099133":1,"GO:0035461":1,"GO:0046677":3,"GO:0099040":1,"GO:0030253":1,"GO:0042760":1,"GO:0001407":1,"GO:0042883":1,"GO:0010949":1,"GO:0006596":1,"GO:0006107":1,"GO:0042158":1,"GO:0046686":1,"GO:0000002":1,"GO:0043504":1,"GO:0097046":1,"GO:0032211":1,"GO:0006310":1,"GO:0044806":1,"GO:0032508":1,"GO:0000723":1,"GO:0051974":1,"GO:1902983":1,"GO:0071932":1,"GO:0043137":1,"GO:1902975":1,"GO:0006278":1,"GO:0039693":1,"GO:1904161":1,"GO:0090305":1,"GO:1903459":1,"GO:0016539":1,"GO:1903460":1,"GO:1902981":1,"GO:0055089":1,"GO:0006279":1,"GO:0045004":1,"GO:0035822":1,"GO:0016311":1,"GO:0019243":1,"GO:0046929":1,"GO:0050884":1,"GO:0032225":1,"GO:0098789":1,"GO:0034247":1,"GO:0090503":1,"GO:0006364":1,"GO:0017001":1,"GO:0031126":1,"GO:0034414":1,"GO:0006119":1,"GO:0045910":1,"GO:0043570":1,"GO:0007050":1,"GO:0006302":1,"GO:0051096":1,"GO:0042771":1,"GO:0036297":1,"GO:0048298":1,"GO:0043111":1,"GO:0061500":1,"GO:0010777":1,"GO:0048304":1,"GO:0007281":1,"GO:0000735":1,"GO:0007534":1,"GO:0008340":1,"GO:0002100":1,"GO:0046109":1,"GO:0009972":1,"GO:0006217":1,"GO:0044206":1,"GO:0009231":1,"GO:0019858":1,"GO:0006147":1,"GO:0008103":1,"GO:2000024":1,"GO:0035011":1,"GO:0031538":1,"GO:0030335":1,"GO:0052704":1,"GO:0009116":1,"GO:0097173":1,"GO:0009254":1,"GO:0006541":1,"GO:0033050":1,"GO:0052699":1,"GO:0034219":1,"GO:0006048":1,"GO:0006189":1,"GO:0006751":1,"GO:0009113":1,"GO:0006351":1,"GO:0070981":1,"GO:0005975":1,"GO:0097175":1,"GO:0019647":1,"GO:0006367":1,"GO:0090239":1,"GO:0006368":1,"GO:0031564":1,"GO:0006362":1,"GO:0042797":1,"GO:0051123":1,"GO:0097190":1,"GO:0006366":1,"GO:0070827":1,"GO:0006386":1,"GO:0001172":1,"GO:0042254":1,"GO:0031440":1,"GO:0010793":1,"GO:2001253":1,"GO:0001193":1,"GO:0006379":1},"recipe_readded":["KAI9190315.1","KAI9184013.1","KAI9168170.1","KAI9190439.1","KAI9183505.1","KAI9172896.1","KAI9173197.1","KAI9159255.1","KAI9189932.1","KAI9183835.1","KAI9152389.1","KAI9164618.1","KAI9190083.1","KAI9184374.1","KAI9178777.1","KAI9189242.1","KAI9173085.1","KAI9151199.1","KAI9189898.1","KAI9179850.1"]}